A partir dos claustros do Convento de S. Paulo podemos observar praticamente todas as salas e dependências do mesmo. A sul temos o refeitório, à sua direita a cozinha, aproveitando o cunhal para sustentar a pesada chaminé. A oeste a sala do capítulo com as suas paredes decoradas, a noroeste as escadas de acesso às celas (hoje terraço) e a nascente a igreja.

É interessante comparar a dimensão espacial deste claustro com o claustro do Convento dos Capuchos. Através destas diferenças, podemos interpretar um pouco das características de cada ordem.

O tom rosado da argamassa das paredes interiores do convento é obtido através da mistura do cimento cal e a areia das imediações do convento. Durante o processo de restauro em 2017, foram analisadas as argamassas do convento que tinham uma coloração rosa. Chegou-se à conclusão que era fruto desta mistura.